KEGG

El KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) (Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto) es una colección de bases de datos en línea de genomas, rutas enzimáticas, y químicos biológicos. La base de datos PATHWAY registra las redes de interacciones moleculares dentro de las células, y variantes de ellas específicas a organismos particulares. A partir de julio de 2011, KEGG ha cambiado a un modelo de suscripción y el acceso a través de FTP ya no es gratis.

Introducción

El KEGG, el Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, fue iniciado por el programa del genoma humano japonés en 1995.^[1] Los desarrolladores consideran a KEGG de ser una "representación informática" del sistema biológico.^[2] La base de datos KEGG puede ser utilizada para la modelización y la simulación, la navegación y extracción de datos. Es parte del enfoque biología de sistemas.

KEGG mantiene cinco bases de datos principales:^[3]

• KEGG Atlas
• KEGG Pathway
• KEGG Genes
• KEGG Ligand
• KEGG BRITE

Referencias

1. ↑ Kanehisa M (1997). «A database for post-genome analysis.». Trends Genet 13 (9):  pp. 375–6. PMID 9287494. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=pubmed&tool=sumsearch.org/cite&retmode=ref&cmd=prlinks&id=9287494. 
2. ↑ Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S et al. (2006). «From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.». Nucleic Acids Res 34 (Database issue):  pp. D354-7. doi:10.1093/nar/gkj102. PMID 16381885. PMC 1347464. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=pubmed&tool=sumsearch.org/cite&retmode=ref&cmd=prlinks&id=16381885. 
3. ↑ Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004). «The KEGG resource for deciphering the genome.». Nucleic Acids Res 32 (Database issue):  pp. D277-80. doi:10.1093/nar/gkh063. PMID 14681412. PMC 308797. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/elink.fcgi?dbfrom=pubmed&tool=sumsearch.org/cite&retmode=ref&cmd=prlinks&id=14681412.